1，五脏的生理活动特点，如肝喜达志，有止泻的功能，有生发“木”的特点，故肝属“木”；心阳具有温煦的功能，具有“火”和阳热的特点，所以心属“火”；脾为生化之源，具有“土”至生化万物的特性，故脾属“土”；肺气主降，具有“金”清敛的特点，故肺属“金”；肾有控水藏精的功能，又有“水”润泽的特性，故肾属“水”。

2.人体脏腑组织生理功能的内在联系。比如肾(水)之精养肝，肝(木)藏血养心，心(火)之热温脾，脾(土)化为水谷之精充肺，肺(金)下助肾。这就是五脏之间的关系。肺(金)气下降，可抑制肝阳上亢；肝(木)之顺，可解除脾土之郁；脾(土)的运化，可以阻止肾水的泛滥；润肾(水)可以防止心火过旺；阳-心热(火)能过分制约肺-气-金-清-素，这是五脏之间的关系。

3.人体与外界环境的关系，比如饮食的四季五味。总之，五行学说在生理学上的应用，在于解释人体脏腑组织之间，以及人体与外界环境之间相互联系的统一性。