对于囊肿部位有限的患者，采用冰敷、膝关节加压包扎等物理治疗，可以减轻疼痛和肿胀。囊肿较少，症状不明显时，适度的关节活动和膝关节周围的肌肉锻炼，有助于减轻肿胀、疼痛等症状，保留膝关节的功能。

对于囊肿内积液较多且无软组织侵犯的患者，可进行囊肿穿刺引流。在超声图像的引导下，用细针穿刺抽吸囊肿内的关节液，以迅速清除肿胀。

超声引导穿刺注射皮质醇是一种风险低、成功率高的治疗方法，针对膝关节骨关节炎合并窝囊肿。一般穿刺注射治疗后几周内，膝关节疼痛肿胀症状可明显改善，囊肿体积明显缩小。